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从零开发一个复杂深度学习模型

Keras 是提供一些高可用的 Python API ,能帮助你快速的构建和训练自己的深度学习模型,它的后端是 TensorFlow 或者 Theano 。 本文假设你已经熟悉了 TensorFlow 和卷积神经网络, 如果,你还没有熟悉,那么可以先看看这个10分钟入门 TensorFlow 教程和卷积神经网络教程,

在这个教程中,我们将学习以下几个方面:

  1. 为什么选择 Keras?为什么 Keras 被认为是深度学习的未来?
  2. 在Ubuntu上面一步一步安装Keras。
  3. Keras TensorFlow教程:Keras基础知识。
  4. 了解 Keras 序列模型 4.1 实际例子讲解线性回归问题
  5. 使用 Keras 保存和回复预训练的模型
  6. Keras API 6.1 使用Keras API开发VGG卷积神经网络 6.2 使用Keras API构建并运行SqueezeNet卷积神经网络

1. 为什么选择Keras?

Keras 是 Google 的一位工程师 François Chollet 开发的一个框架,可以帮助你在 Theano 上面进行快速原型开发。后来,这被扩展为 TensorFlow 也可以作为后端。并且最近,TensorFlow决定将其作为 contrib 文件中的一部分进行提供。 Keras 被认为是构建神经网络的未来,以下是一些它流行的原因:

  1. 轻量级和快速开发:Keras 的目的是在消除样板代码。几行 Keras 代码就能比原生的 TensorFlow 代码实现更多的功能。你也可以很轻松的实现 CNN 和 RNN,并且让它们运行在 CPU 或者 GPU 上面。
  2. 框架的“赢者”:Keras 是一个API,运行在别的深度学习框架上面。这个框架可以是 TensorFlow 或者 Theano。Microsoft 也计划让 CNTK 作为 Keras 的一个后端。目前,神经网络框架世界是非常分散的,并且发展非常快。具体,你可以看看 Karpathy 的这个推文:

想象一下,我们每年都要去学习一个新的框架,这是多么的痛苦。到目前为止,TensorFlow 似乎成为了一种潮流,并且越来越多的框架开始为 Keras 提供支持,它可能会成为一种标准。 目前,Keras 是成长最快的一种深度学习框架。因为可以使用不同的深度学习框架作为后端,这也使得它成为了流行的一个很大的原因。你可以设想这样一个场景,如果你阅读到了一篇很有趣的论文,并且你想在你自己的数据集上面测试这个模型。让我们再次假设,你对TensorFlow 非常熟悉,但是对Theano了解的非常少。那么,你必须使用TensorFlow 对这个论文进行复现,但是这个周期是非常长的。但是,如果现在代码是采用Keras写的,那么你只要将后端修改为TensorFlow就可以使用代码了。这将是对社区发展的一个巨大的推动作用。

2. 怎么安装Keras,并且把TensorFlow作为后端

a) 依赖安装 安装 h5py,用于模型的保存和载入: pip install h5py 还有一些依赖包也要安装。 pip install numpy scipy pip install pillow 如果你还没有安装TensorFlow,那么你可以按照这个教程先去安装TensorFlow。一旦,你安装完成了 TensorFlow,你只需要使用 pip 很容易的安装 Keras。 sudo pip install keras 使用以下命令来查看 Keras 版本。

import keras Using TensorFlow backend. keras.version '2.0.4' 一旦,Keras 被安装完成,你需要去修改后端文件,也就是去确定,你需要 TensorFlow 作为后端,还是 Theano 作为后端,修改的配置文件位于 ~/.keras/keras.json 。具体配置如下: { "floatx": "float32", "epsilon": 1e-07, "backend": "tensorflow", "image_data_format": "channels_last" } 请注意,参数 image_data_format 是 channels_last ,也就是说这个后端是 TensorFlow。因为,在TensorFlow中图像的存储方式是[height, width, channels],但是在Theano中是完全不同的,也就是 [channels, height, width]。因此,如果你没有正确的设置这个参数,那么你模型的中间结果将是非常奇怪的。对于Theano来说,这个参数就是channels_first。 那么,至此你已经准备好了,使用Keras来构建模型,并且把TensorFlow作为后端。

3. Keras基础知识

在Keras中主要的数据结构是 model ,该结构定义了一个完整的图。你可以向已经存在的图中加入任何的网络结构。 import keras Keras 有两种不同的建模方式:

  1. Sequential models:这种方法用于实现一些简单的模型。你只需要向一些存在的模型中添加层就行了。
  2. Functional API:Keras的API是非常强大的,你可以利用这些API来构造更加复杂的模型,比如多输出模型,有向无环图等等。 在本文的下一节中,我们将学习Keras的Sequential models 和 Functional API的理论和实例。

4. Keras Sequential models

在这一部分中,我将来介绍Keras Sequential models的理论。我将快速的解释它是如何工作的,还会利用具体代码来解释。之后,我们将解决一个简单的线性回归问题,你可以在阅读的同时运行代码,来加深印象。 以下代码是如何开始导入和构建序列模型。 from keras.models import Sequential models = Sequential() 接下来我们可以向模型中添加 Dense(full connected layer),Activation,Conv2D,MaxPooling2D函数。 from keras.layers import Dense, Activation, Conv2D, MaxPooling2D, Flatten, Dropout model.add(Conv2D(64, (3,3), activation='relu', input_shape = (100,100,32)))

This ads a Convolutional layer with 64 filters of size 3 * 3 to the graph

以下是如何将一些最流行的图层添加到网络中。我已经在卷积神经网络教程中写了很多关于图层的描述。

  1. 卷积层 这里我们使用一个卷积层,64个卷积核,维度是33的,之后采用 relu 激活函数进行激活,输入数据的维度是 100100*32。注意,如果是第一个卷积层,那么必须加上输入数据的维度,后面几个这个参数可以省略。 model.add(Conv2D(64, (3,3), activation='relu', input_shape = (100,100,32)))
  2. MaxPooling 层 指定图层的类型,并且指定赤的大小,然后自动完成赤化操作,酷毙了! model.add(MaxPooling2D(pool_size=(2,2)))
  3. 全连接层 这个层在 Keras 中称为被称之为 Dense 层,我们只需要设置输出层的维度,然后Keras就会帮助我们自动完成了。 model.add(Dense(256, activation='relu'))
  4. Dropout model.add(Dropout(0.5))
  5. 扁平层 model.add(Flatten()) 数据输入 网络的第一层需要读入训练数据。因此我们需要去制定输入数据的维度。因此,input_shape参数被用于制定输入数据的维度大小。 model.add(Conv2D(32, (3,3), activation='relu', input_shape=(224, 224, 3))) 在这个例子中,数据输入的第一层是一个卷积层,输入数据的大小是 2242243 。 以上操作就帮助你利用序列模型构建了一个模型。接下来,让我们学习最重要的一个部分。一旦你指定了一个网络架构,你还需要指定优化器和损失函数。我们在Keras中使用compile函数来达到这个功能。比如,在下面的代码中,我们使用 rmsprop 来作为优化器,binary_crossentropy 来作为损失函数值。 model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='rmsprop') 如果你想要使用随机梯度下降,那么你需要选择合适的初始值和超参数: from keras.optimizers import SGD sgd = SGD(lr=0.01, decay=1e-6, momentum=0.9, nesterov=True) model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer=sgd) 现在,我们已经构建完了模型。接下来,让我们向模型中输入数据,在Keras中是通过 fit 函数来实现的。你也可以在该函数中指定 batch_size 和 epochs 来训练。 model.fit(x_train, y_train, batch_size = 32, epochs = 10, validation_data(x_val, y_val)) 最后,我们使用 evaluate 函数来测试模型的性能。 score = model.evaluate(x_test, y_test, batch_size = 32) 这些就是使用序列模型在Keras中构建神经网络的具体操作步骤。现在,我们来构建一个简单的线性回归模型。 4.1 实际例子讲解线性回归问题 问题陈述 在线性回归问题中,你可以得到很多的数据点,然后你需要使用一条直线去拟合这些离散点。在这个例子中,我们创建了100个离散点,然后用一条直线去拟合它们。 a) 创建训练数据 TrainX 的数据范围是 -1 到 1,TrainY 与 TrainX 的关系是3倍,并且我们加入了一些噪声点。 import keras from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense import numpy as np trX = np.linspace(-1, 1, 101) trY = 3 * trX + np.random.randn(*trX.shape) * 0.33 b) 构建模型 首先我们需要构建一个序列模型。我们需要的只是一个简单的链接,因此我们只需要使用一个 Dense 层就够了,然后用线性函数进行激活。 model = Sequential() model.add(Dense(input_dim=1, output_dim=1, init='uniform', activation='linear')) 下面的代码将设置输入数据 x,权重 w 和偏置项 b。然我们来看看具体的初始化工作。如下: weights = model.layers[0].get_weights() w_init = weights[0][0][0] b_init = weights[1][0] print('Linear regression model is initialized with weights w: %.2f, b: %.2f' % (w_init, b_init))

Linear regression model is initialized with weight w: -0.03, b: 0.00

现在,我们可以l利用自己构造的数据 trX 和 trY 来训练这个线性模型,其中 trY 是 trX 的3倍。因此,权重 w 的值应该是 3。 我们使用简单的梯度下降来作为优化器,均方误差(MSE)作为损失值。如下: model.compile(optimizer='sgd', loss='mse') 最后,我们使用 fit 函数来输入数据。 model.fit(trX, trY, nb_epoch=200, verbose=1) 在经过训练之后,我们再次打印权重: weights = model.layers[0].get_weights() w_final = weights[0][0][0] b_final = weights[1][0] print('Linear regression model is trained to have weight w: %.2f, b: %.2f' % (w_final, b_final)) ##Linear regression model is trained to have weight w: 2.94, b: 0.08 正如你所看到的,在运行 200 轮之后,现在权重非常接近于 3。你可以将运行的轮数修改为区间 [100, 300] 之间,然后观察输出结构有什么变化。现在,你已经学会了利用很少的代码来构建一个线性回归模型,如果要构建一个相同的模型,在 TensorFlow 中需要用到更多的代码。

5. 使用 Keras 保存和回复预训练的模型

HDF5 二进制格式 一旦你利用Keras完成了训练,你可以将你的网络保存在HDF5里面。当然,你需要先安装 h5py。HDF5 格式非常适合存储大量的数字收,并从 numpy 处理这些数据。比如,我们可以轻松的将存储在磁盘上的多TB数据集进行切片,就好像他们是真正的 numpy 数组一样。你还可以将多个数据集存储在单个文件中,遍历他们或者查看 .shape 和 .dtype 属性。 如果你需要信心,那么告诉你,NASA也在使用 HDF5 进行数据存储。h5py 是python对HDF5 C API 的封装。几乎你可以用C在HDF5上面进行的任何操作都可以用python在h5py上面操作。 保存权重 如果你要保存训练好的权重,那么你可以直接使用 save_weights 函数。 model.save_weights("my_model.h5") 载入预训练权重 如果你想要载入以前训练好的模型,那么你可以使用 load_weights 函数。 model.load_weights('my_model_weights.h5')

6. Keras API

如果对于简单的模型和问题,那么序列模型是非常好的方式。但是如果你要构建一个现实世界中复杂的网络,那么你就需要知道一些功能性的API,在很多流行的神经网络中,我们都有一个最小的网络结构,完整的模型是根据这些最小的模型进行叠加完成的。这些基础的API可以让你一层一层的构建模型。因此,你只需要很少的代码就可以来构建一个完整的复杂神经网络。 让我们来看看它是如何工作的。首先,你需要导入一些包。 from keras.models import Model 现在,你需要去指定输入数据,而不是在顺序模型中,在最后的 fit 函数中输入数据。这是序列模型和这些功能性的API之间最显著的区别之一。我们使用 input() 函数来申明一个 12828 的张量。 from keras.layers import Input

First, define the vision modules

digit_input = Input(shape=(1, 28, 28)) 现在,让我们来利用API设计一个卷积层,我们需要指定要在在哪个层使用卷积网络,具体代码这样操作: x = Conv2D(64, (3, 3))(digit_input) x = Conv2D(64, (3, 3))(x) x = MaxPooling2D((2, 2))(x) out = Flatten()(x) 最后,我们对于指定的输入和输出数据来构建一个模型。 vision_model = Model(digit_input, out) 当然,我们还需要指定损失函数,优化器等等。但这些和我们在序列模型中的操作一样,你可以使用 fit 函数和 compile 函数来进行操作。 接下来,让我们来构建一个vgg-16模型,这是一个很大很“老”的模型,但是由于它的简洁性,它是一个很好的学习模型。 6.1 使用Keras API开发VGG卷积神经网络 VGG: VGG卷积神经网络是牛津大学在2014年提出来的模型。当这个模型被提出时,由于它的简洁性和实用性,马上成为了当时最流行的卷积神经网络模型。它在图像分类和目标检测任务中都表现出非常好的结果。在2014年的ILSVRC比赛中,VGG 在Top-5中取得了92.3%的正确率。 该模型有一些变种,其中最受欢迎的当然是 vgg-16,这是一个拥有16层的模型。你可以看到它需要维度是 2242243 的输入数据。

让我们来写一个独立的函数来完整实现这个模型。 img_input = Input(shape=input_shape)

Block 1

x = Conv2D(64, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block1_conv1')(img_input) x = Conv2D(64, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block1_conv2')(x) x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block1_pool')(x)

Block 2

x = Conv2D(128, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block2_conv1')(x) x = Conv2D(128, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block2_conv2')(x) x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block2_pool')(x)

Block 3

x = Conv2D(256, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block3_conv1')(x) x = Conv2D(256, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block3_conv2')(x) x = Conv2D(256, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block3_conv3')(x) x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block3_pool')(x)

Block 4

x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block4_conv1')(x) x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block4_conv2')(x) x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block4_conv3')(x) x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block4_pool')(x)

Block 5

x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block5_conv1')(x) x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block5_conv2')(x) x = Conv2D(512, (3, 3), activation='relu', padding='same', name='block5_conv3')(x) x = MaxPooling2D((2, 2), strides=(2, 2), name='block5_pool')(x)

x = Flatten(name='flatten')(x) x = Dense(4096, activation='relu', name='fc1')(x) x = Dense(4096, activation='relu', name='fc2')(x) x = Dense(classes, activation='softmax', name='predictions')(x) 我们可以将这个完整的模型,命名为 vgg16.py。 在这个例子中,我们来运行 imageNet 数据集中的某一些数据来进行测试。具体代码如下: model = applications.VGG16(weights='imagenet') img = image.load_img('cat.jpeg', target_size=(224, 224)) x = image.img_to_array(img) x = np.expand_dims(x, axis=0) x = preprocess_input(x) preds = model.predict(x) for results in decode_predictions(preds): for result in results: print('Probability %0.2f%% => [%s]' % (100*result[2], result[1]))正如你在图中看到的,模型会对图片中的物体进行一个识别预测。 我们通过API构建了一个VGG模型,但是由于VGG是一个很简单的模型,所以并没有完全将API的能力开发出来。接下来,我们通过构建一个 SqueezeNet模型,来展示API的真正能力。 6.2 使用Keras API构建并运行SqueezeNet卷积神经网络 SequeezeNet 是一个非常了不起的网络架构,它的显著点不在于对正确性有多少的提高,而是减少了计算量。当SequeezeNet的正确性和AlexNet接近时,但是ImageNet上面的预训练模型的存储量小于5 MB,这对于在现实世界中使用CNN是非常有利的。SqueezeNet模型引入了一个 Fire模型,它由交替的 Squeeze 和 Expand 模块组成。

现在,我们对 fire 模型进行多次复制,从而来构建完整的网络模型,具体如下: 为了去构建这个网络,我们将利用API的功能首先来构建一个单独的 fire 模块。

Squeeze part of fire module with 1 * 1 convolutions, followed by Relu

x = Convolution2D(squeeze, (1, 1), padding='valid', name='fire2/squeeze1x1')(x) x = Activation('relu', name='fire2/relu_squeeze1x1')(x)

#Expand part has two portions, left uses 1 * 1 convolutions and is called expand1x1  left = Convolution2D(expand, (1, 1), padding='valid', name='fire2/expand1x1')(x) left = Activation('relu', name='fire2/relu_expand1x1')(left)

#Right part uses 3 * 3 convolutions and is called expand3x3, both of these are follow#ed by Relu layer, Note that both receive x as input as designed.  right = Convolution2D(expand, (3, 3), padding='same', name='fire2/expand3x3')(x) right = Activation('relu', name='fire2/relu_expand3x3')(right)

Final output of Fire Module is concatenation of left and right. 

x = concatenate([left, right], axis=3, name='fire2/concat') 为了重用这些代码,我们可以将它们转换成一个函数: sq1x1 = "squeeze1x1" exp1x1 = "expand1x1" exp3x3 = "expand3x3" relu = "relu_" WEIGHTS_PATH = "https://github.com/rcmalli/keras-squeezenet/releases/download/v1.0/squeezenet_weights_tf_dim_ordering_tf_kernels.h5" 模块化处理 sq1x1 = "squeeze1x1" exp1x1 = "expand1x1" exp3x3 = "expand3x3" relu = "relu_"

def fire_module(x, fire_id, squeeze=16, expand=64): s_id = 'fire' + str(fire_id) + '/' x = Convolution2D(squeeze, (1, 1), padding='valid', name=s_id + sq1x1)(x) x = Activation('relu', name=s_id + relu + sq1x1)(x)

left = Convolution2D(expand, (1, 1), padding='valid', name=s_id + exp1x1)(x) left = Activation('relu', name=s_id + relu + exp1x1)(left)

right = Convolution2D(expand, (3, 3), padding='same', name=s_id + exp3x3)(x) right = Activation('relu', name=s_id + relu + exp3x3)(right)

x = concatenate([left, right], axis=3, name=s_id + 'concat') return x 现在,我们可以利用我们构建好的单独的 fire 模块,来构建完整的模型。 x = Convolution2D(64, (3, 3), strides=(2, 2), padding='valid', name='conv1')(img_input) x = Activation('relu', name='relu_conv1')(x) x = MaxPooling2D(pool_size=(3, 3), strides=(2, 2), name='pool1')(x)

x = fire_module(x, fire_id=2, squeeze=16, expand=64) x = fire_module(x, fire_id=3, squeeze=16, expand=64) x = MaxPooling2D(pool_size=(3, 3), strides=(2, 2), name='pool3')(x)

x = fire_module(x, fire_id=4, squeeze=32, expand=128) x = fire_module(x, fire_id=5, squeeze=32, expand=128) x = MaxPooling2D(pool_size=(3, 3), strides=(2, 2), name='pool5')(x)

x = fire_module(x, fire_id=6, squeeze=48, expand=192) x = fire_module(x, fire_id=7, squeeze=48, expand=192) x = fire_module(x, fire_id=8, squeeze=64, expand=256) x = fire_module(x, fire_id=9, squeeze=64, expand=256) x = Dropout(0.5, name='drop9')(x)

x = Convolution2D(classes, (1, 1), padding='valid', name='conv10')(x) x = Activation('relu', name='relu_conv10')(x) x = GlobalAveragePooling2D()(x) out = Activation('softmax', name='loss')(x)

model = Model(inputs, out, name='squeezenet') 完整的网络模型我们放置在 squeezenet.py 文件里。我们应该先下载 imageNet 预训练模型,然后在我们自己的数据集上面进行训练和测试。下面的代码就是实现了这个功能: import numpy as np from keras_squeezenet import SqueezeNet from keras.applications.imagenet_utils import preprocess_input, decode_predictions from keras.preprocessing import image

model = SqueezeNet()

img = image.load_img('pexels-photo-280207.jpeg', target_size=(227, 227)) x = image.img_to_array(img) x = np.expand_dims(x, axis=0) x = preprocess_input(x)

preds = model.predict(x) all_results = decode_predictions(preds) for results in all_results: for result in results: print('Probability %0.2f%% => [%s]' % (100*result[2], result[1]))

对于相同的一幅图预测,我们可以得到如下的预测概率。

至此,我们的Keras TensorFlow教程就结束了